Στη φιλοσοφία ο Νεύτωνας ορίζεται ως φυσικός φιλόσοφος και είναι ο πρώτος που απαντά στην καρτεσιανή κοσμολογία και τον καρτεσιανό ορθολογισμό που βασίζεται στην απόλυτη εγκυρότητα των μαθηματικών και τις a priori μεταφυσικές αρχές. Ο Νεύτωνας εισάγει την πειραματική μέθοδο και τις εμπειρικές παρατηρήσεις και μελετά την ύλη όπως εμφανίζεται στη φυσική πραγματικότητα και όχι την ουσία της όπως ο Καρτέσιος. Απ' αυτόν δίνεται η ώθηση στις αιτιοκρατικές αντιλήψεις οι οποίες βεβαίως μεταφέρονται στη φιλοσοφία με πιο γνωστή τη μαρξιστική αντίληψη του κράτους.