Δοκίμασε να φορμάρεις την κάρτα σε exFAT αντί FAT32. Αν το υποστηρίζει η κάμερά σου, δε θα "σπάει" τα αρχεία σε κομμάτια των ~4GB.
Το YouTube κωδικοποιεί με έμφαση στο streaming speed, όχι την ποιότητα. Ειδικά αν δεν ξέρεις ακριβώς τι κάνεις με το βίντεό σου. Παρ'όλα αυτά δώσ'του μερικές ώρες, μπορεί να φτιάξει η ποιότητα (ναι, το κάνει και αυτό το YT).